首先給各位水族玩家講解下水草在自然界里的狀態，水草原生的原生地“河川或湖泊”，時時都有新的水流入，水草利用水中含有的 CO2，及從太陽光的能量來行光合作用；根從土壤中吸收由微生物分解的有機物，另外葉子從水中吸收營養素，如此可有效抑制河川及湖泊的營養化。還有自然界中有無數的原生動物和微生物存在，可將有機物、浮游物有效分解，而凈化了水質，如前所述，自然界本身就有一個平衡的生態系，具備水質凈化的系統。
過濾的條件
但是對於我們水族玩家的水族箱來說，是一個完全封閉的世界，不具備自然界良好的條件，因此在之中種植水草，非得人為添加CO2設置，多的燈光及完整的過濾設備不可。在此之中過濾裝置於有限的水量，扮演一個維持平穩生態系重要角色。
如果魚缸中的魚及草的數量少時，其實使用何種過濾效果都差不多，但一般水草缸都希望有密植的水草，尤其是較矮的水草更需要有充足的光量，因此必須有充分置放燈具的空間，另外水草也需要充足CO2，故溶入水中的CO2要盡量避免逸散，根據以上的需求來定出過濾器所需的條件：
1、有充分放置照明設備的空間；
2、CO2不易逸散；
3、維持長期的高過濾能力。
過濾器的種類及優缺點分析
從以上所需條件來看，哪種為適用的種類呢？
一、上部過濾
因設置於魚缸上部，照明設備所能放置的空間減少（特別是螢光燈具），如果水草密植要考慮到光量不足的現象，在過濾器的構造上，水通過過濾槽時會與空氣接觸，如此CO2也會隨之逸散到空氣中。
優點：
1、因為是裝置在魚缸上部，故在清潔保養上非常方便；
2、在構造上容易將CO2逸散，對於養魚來說非常適合。
缺點：
1、在構造上CO2與空氣接觸面積大，易逸散掉；
2、在照明設備的放置空間會受限，不適合水草的培育。
二、底部過濾
底床內會產生水流，使水中與底床幾乎無溫度差，另外又能補充底床氧氣，對於水草而言，理論上是很適合，但是水的凈化是利用底砂作為過濾器，水必須通過砂的間隙，而水草的根也是利用砂的間隙成長，如果水草長的非常茂密時根的叢生也是必然，因而砂粒間水的通路變少，過濾的效果會隨之降低，故用於希望長期維持的水景是不適用的。
優點：
1、底床內會產生水流，底床與水中的溫度差變小；
2、可供應底床微生物較多的氧氣，有益微生物繁衍。
缺點：
1、底床面水草生長茂盛時，草根易將砂隙阻塞，故不易長期維持水質穩定；
2、底肥易流失，在水草缸不適合使用
三、內部過濾
因設置於魚缸內部，因此過濾槽不會太大，過濾能力會受限，還有在觀瞻上也有影響。
優點：
1、有充分放置照明設備的空間；
2、CO2不易逸散；
3、底床也沒問題，又有水流，符合種植水草的條件。
缺點：
1、設置於魚缸內部，水草栽種空間受限；
2、會影響到整體的美觀。
四、外部過濾
優點：
1、可於魚缸上部充分設置照明設備；
2、水草生長所需CO2不易逸散；
3、過濾槽的能力較強。
缺點：
水溫易受外面氣溫影響。
這三個優點剛好符合上述水草需要條件，故水草缸以密閉式外部過濾為最適合。
以上四種是我們魚友過濾的基本種類。
濾材的介紹
使用密閉式外部過濾，在過濾桶內會有許多濾材，濾材本身大約具備“物理過濾”、“化學過濾”和“生物過濾”三種功能。
1、物理過濾
主要是使用網狀物，及羊毛，將水中較大的雜物除去。
2、化學過濾
利用活性碳吸附，除去導致水混濁的有機物及魚的排泄物。
3、生物過濾
利用在濾材表面所繁衍的微生物，或原生動物的活動來過濾，培養有益微生物正常生長，需要花一些時間，同時也要有適當的環境，過濾效果的好壞，幾乎都取決於生物過濾的能力。要發揮最大的過濾功能，就必須將上述三種功能作最佳組合 。
生物過濾的功能
單單隻靠物理過濾及化學過濾，並無法將污水中所含阿摩尼亞及細菌除去，因此要靠附着在濾材表面的有益微生物(分為需要氧氣的好氧性微生物及不須氧氣的厭氧性微生物)，及原生動物來凈化，以下就好氧性、厭氧性微生物及原生動物的功用作說明：
1、好氧性微生物
可將污水中的浮游物和有機物分解，另外會將有毒性的阿摩尼亞轉換為亞硝酸，甚至可成為完全沒有毒性的硝酸（硝化菌的硝化作用）。
2、厭氧性微生物
可將好氧性微生物酸化作用所產生的硝酸性氮氣，分解為氮氣瓦斯、碳酸瓦斯等來達到凈化水質的效果。
3、原生動物
除有效微生物外，另外尚須存在有效原生動物，將會引起魚病的細菌類捕食。
因此在一個健全的生物過濾的水草缸，魚只不容易生病。
過濾系統的建立
如前述，要能夠使過濾效果，其生物過濾是最重要的，但是在應用生物過濾時，有哪一些是必須注意的呢？
首先是在水草缸設立初期，會有較多的問題，水草缸設立初期，水上葉的枯葉，造成水中會有阿摩尼亞及垃圾的產生，水質呈現較髒的狀態，加上設立初期在濾材內層，並未生成微生物，僅能靠物理過濾及化學過濾，依賴吸附作用凈化水質是有限的，一兩周后吸附的能力就會消失，因此在此段期間換水要較頻繁（狀況不佳者每日約換三分之一），以人為的水凈化來彌補，另外為促成微生物的長成，夜間加以打空氣，補給水草缸及過濾槽氧氣，待微生物在濾材內層表面生成后，生物過濾的機能才算開始，擁有生物過濾正常機能的水草缸，對於藻類、病原菌有相當的抵抗力，故水草可順利生長。
過濾系統的清洗
過濾槽經過一段時間，濾材會有一些較細的污物造成阻塞，而使得過濾槽內的通水性變差，水的流量減少，此時，因為無法供應充足的氧氣，微生物的活動力降低，過濾的功用也大打折扣。因此定期洗凈過濾槽是必要的，發現過濾水流變弱時，便施行清理是較好的，但是在清洗時，要特別注意不可破壞生物系統（避免殺死繁殖良好的微生物）。
在清洗過濾槽時，將濾材取出后，如使用自來水（其中含有氯等殺菌物）、冰水或熱水洗凈，會將濾材中有益微生物殺死，因此在清洗時必須使用原缸中之水，輕輕沖洗，去掉濾材間隙的污物，但必須避免洗掉微生物，而破壞了好不容易建立起來的生物過濾系統 。
通常水草缸的成敗，可說在於設缸后一個月，此根據在三強調的生物過濾系統，建立的時間約一個月，此段期間的維護及之後水質的管理，會決定水草生長好壞與否。
過濾的流量
現在市面上有很多種類的過濾器，但過濾效果的好壞，不在於價格的高低，而是在於是否選擇了適當的過濾器，有效利用眼睛所未能見的有益微生物，進行水質凈化，並維持水草缸的健康生態。
如何選擇適當的過濾器呢？
一、先檢視水缸內的養殖狀況，來決定水流循環的次數。
1、純水草缸，未飼養魚只——每小時水循環2次。
2、水草缸中飼養小型魚只——每小時水循環3次。
3、水草密植，魚只密集——每小時水循環4～5次。
[Tips]依實際養魚的密度（魚只大小之拉糞量）。
二、配合水草缸的大小，來決定過濾器的流量。如水草缸中飼養燈科魚，水缸大小為100公升，則每小時需有300公升的濾水量。
三、在計算流量時，請注意當過濾器啟動過濾一段時間后，會有污物阻塞濾材，減低水的流量，因此除要定期清洗濾材外，在計算流量時，要乘以一點二倍，較為合適。因此以上述之100公升水草缸中，飼養燈科魚，需要每小時300公升×1.2倍＝每小時360公升的過濾的流量。
